民營研發(fā)型企業(yè)，一般具有“四高”特點：即科技人員集中度高，一般占職工比例的50%以上，有三分之一以上科技人員專職從事新產(chǎn)品的研發(fā)工作，研發(fā)能力比較強；研發(fā)經(jīng)費投入高，一般占產(chǎn)品銷售額的5%至10%以上，有些新產(chǎn)品（如生物醫(yī)藥）的研發(fā)要連續(xù)投入5至10年以上才能形成產(chǎn)品；產(chǎn)品的技術含量高，絕大多數(shù)是由具有發(fā)明專利的科技成果轉化而成，擁有自主知識產(chǎn)權；產(chǎn)品的市場開拓和經(jīng)銷費用高，除產(chǎn)品適應市場需求外，要投入很大的人力、物力和財力，用新思想和新概念去引導市場發(fā)展。這類研發(fā)型民營高新技術企業(yè)，實質上就是"中共中央、國務院關于實施科技規(guī)劃綱要增強自主創(chuàng)新能?Phi;木齠?中強調鼓勵發(fā)展的創(chuàng)新型科技企業(yè)。
這類創(chuàng)新型科技企業(yè)，手中有技術、有產(chǎn)品，又有市場需要，為什么它們的成長速度在"九五"、"十五"期間反而比加工型、房產(chǎn)型等企業(yè)慢？不少企業(yè)家反映，其主要原因是由于我國的體制、機制以及稅收、投資等環(huán)境政策不完善所造成的。就現(xiàn)行的稅收政策來說，不是在激勵技術創(chuàng)新，而是在嚴重地束縛這類研發(fā)型企業(yè)的技術創(chuàng)新和成長發(fā)展。目前反映的突出問題有以下四個方面：
1、我國現(xiàn)行的增值稅是生產(chǎn)型增值稅，它所實行的原則（應納稅額=當期銷項稅額-當期進項稅額）只有利于加工型、房產(chǎn)型這類企業(yè)發(fā)展，而不利于研發(fā)型企業(yè)成長。由于研發(fā)型企業(yè)主要靠智力勞動，所消耗的原材料、動力等成本多數(shù)只有30%以下，不及加工型、房產(chǎn)型企業(yè)的半數(shù)，一些軟件產(chǎn)品占主要成分的企業(yè)，原材料等費用更是少數(shù)，因而能抵扣的當期進項稅額十分有限，自然所形成的應納稅額就高。目前民營研發(fā)型高新企業(yè)中，增值稅負擔要占70%以上，有的甚至超過80%，產(chǎn)品在生產(chǎn)過程中形成的增值大部分交了稅，不利于企業(yè)的繼續(xù)擴大投入。
2、現(xiàn)行增值稅的進項稅額中，不允許抵扣購買固定資產(chǎn)設備費用，這不利于技術創(chuàng)新。民營高新技術企業(yè)的技術創(chuàng)新，主要是靠人才的智力水平和先進的技術設備，兩者相輔相成，缺一不可，只有先進的人力水平加先進的技術手段，才能生產(chǎn)出先進的產(chǎn)品。為了研發(fā)高新技術產(chǎn)品，民營高新技術企業(yè)在購買先進技術設備方面，一般成本高昂，所應用的一些高新技術也逐步物化在所購買的技術設備中，而這些設備不允許在進項稅額中抵扣，一律放在固定資產(chǎn)折舊中處理，一方面資金回收速度緩慢，另一方面又加重了企業(yè)的納稅負擔，不利于企業(yè)的技術創(chuàng)新。
3.現(xiàn)行企業(yè)所得稅中規(guī)定的“計稅工資”限額太低，不利于技術創(chuàng)新。為了趕超世界先進技術水平，我國民營高新技術企業(yè)多數(shù)保持了一個科技人才高度密集的集體，有的企業(yè)科技人員竟高達80%以上，為使這個隊伍保持旺盛活力，企業(yè)在工資、獎金和福利方面給予了優(yōu)厚的待遇，其人均月工資水平要大大高于一般工業(yè)企業(yè)，多數(shù)科學家和工程師的月工資一般在東部省市為8000元至萬元以上，其工資獎金總額已是生產(chǎn)成本的主要組成部分，有的要占成本的20%以上。而企業(yè)所得稅中規(guī)定的計入成本的“計稅工資”限額，只有900元至1200元的范圍，在此范圍以外的工資、獎金要企業(yè)從稅后利潤中支付。這樣做，一方面加大了企業(yè)人力資本的負擔，，大大減少了稅后的純利潤，無力繼續(xù)擴大技術創(chuàng)新的投入；另一方面在企業(yè)用稅后利潤發(fā)放職工工資、獎金時，為穩(wěn)住人才，還不得不替?zhèn)€人交一次個人所得稅，就造成了重復交所得稅現(xiàn)象。
4.現(xiàn)行企業(yè)所得稅中規(guī)定按計稅工資1.5%至2.5%的比例抵扣職工教育經(jīng)費，這個限額不合理，也不利于技術創(chuàng)新。民營開發(fā)型高新企業(yè)，一般都是學習型企業(yè)，職工的培訓教育任務十分繁重，不僅每個新產(chǎn)品、新工藝出臺時要對職工系統(tǒng)進行培訓，有些為長遠戰(zhàn)略著想，還要分期分批將科技人員或職工派往國內外重點高校、重點科研究院所專門進行培養(yǎng)，以保證企業(yè)的科技進步。不少研發(fā)型企業(yè)反映，他們的職工教育經(jīng)費早已突破1.5%至2.5%計稅工資限額，這個限額太低，不利于企業(yè)加強職工的技術教育和提高科學技術水平。
綜合以上幾方面情況，民營開發(fā)型高新企業(yè)不僅增值稅 的負擔很重，其所得稅的負擔也很重。目前各種稅收加在一起，民營開發(fā)型高新企業(yè)要占產(chǎn)品銷售額的8-11%，有些甚至超過11%。這個比例要比一般加工制造企業(yè)高1.7倍（一般加工制造業(yè)企業(yè)平均交稅為4%左右），比房產(chǎn)型企業(yè)高出1.2倍（一般房產(chǎn)型企業(yè)平均交稅為5%左右）。而且越是創(chuàng)新，企業(yè)所交的稅就越重。
為鼓勵企業(yè)技術創(chuàng)新，2006年2月7日國務院國發(fā)[2006]6號文件對稅收激勵問題提出了8方面的政策措施，這從根本上突破了現(xiàn)行增值稅和企業(yè)所得稅條例的框框，受到廣大民營科技企業(yè)的擁護。為盡快落實這些政策措施，推進現(xiàn)有稅 收條例的修改，針對上述問題提出如下幾點對策建議：
第一，國務院提出允許企業(yè)按當年實際發(fā)生的技術開發(fā)費用的150%抵扣當年應納稅的所得額。此項政策對一般的工業(yè)企業(yè)是合適的；對于研發(fā)型的民營高新技術企業(yè)來說，建議在增值稅中抵扣為佳，因為這類企業(yè)可抵扣的進項稅額太少，應交的增值稅額太重。
第二，國務院提出允許企業(yè)用于研發(fā)的儀器設備，單價在30萬元以下的可一次或分次攤入管理費，而單價在30萬元以上可采取加速折舊的政策。建議加速折舊的年限參考發(fā)達國家制定的標準執(zhí)行，以保證企業(yè)盡快收回投資用于技術創(chuàng)新。
第三，在嚴格審核和認定的基礎上，對研發(fā)型民營高新技術企業(yè)以發(fā)明專利、重大國家科技成果產(chǎn)業(yè)化為基礎創(chuàng)造的國家級名牌產(chǎn)品、國家級重點新產(chǎn)品等實行增值稅收優(yōu)惠政策，以推動企業(yè)品牌產(chǎn)品建設，為這類企業(yè)技術創(chuàng)新和加速成長提供環(huán)境條件。
第四，如果當前國家為保證稅收增長，還沒有實力做到將內資民營高新企業(yè)人員工資、獎金全部劃入企業(yè)成本核算，在所得稅前據(jù)實扣除，建議先將科技人員的工資、獎金等全部進入企業(yè)成本，在所得稅前據(jù)實扣除，以推進這類企業(yè)的技術創(chuàng)新。
第五，開發(fā)型民營高新企業(yè)的職工教育經(jīng)費，對于提高企業(yè)職工素質、推進企業(yè)科技進步具有重要的作用，建議在進一步明確具體范圍的基礎上，放寬比例限制，可在所得稅前據(jù)實扣除。
第六，針對開發(fā)型民營高新技術企業(yè)“四高”的特點，要改革目前的生產(chǎn)型增值稅，向消費型增值稅轉型，國家僅有東北地區(qū)的改革試點經(jīng)驗還是不夠的，建議在北京科技園區(qū)和深圳高新區(qū)進一步試點，以取得更為全面的改革經(jīng)驗。

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